نشأت الكلية التطبيقية تحت مسمى كلية المجتمع بتوجيهات ملكية في عام 1423هـ حيث كانت تعد إحدى الكليات التابعة لجامعة الملك خالد بأبها، وهي النواة التي أنشئت منها جامعة نجران عام 1427هـ، وقد كانت تحتوي على ثلاثة أقسام: قسم العلوم الطبية التطبيقية وقسم الحاسب وقسم العلوم الإدارية. كما تم تغيير مسمى كلية المجتمع الى الكلية التطبيقية بناءً على قرار مجلس شؤون الجامعات بتاريخ 14-9-1443هـ ، وتقدم الكلية التطبيقية البرامج التالية حالياً